Город Харбор Прайм успешно контролируется корпорацией «Комплекс», при этом эта организация вдет исследования в объединении сознания всех граждан. Игра «Dex» повествует про героиню по имени Декс, которая является частью секретно разработанной программы, позволяющей контролировать население. Поскольку цивилизация продвинулась слишком далеко за короткий промежуток времени, то психика людей неоднозначно реагировала на новые нововведения в гражданской жизни. Чтобы избежать эксцессов, а заодно и взять под полный контроль человечество, было решено теневыми правителями запихать жителей в специальный проект объединения сознания.
Но именно Декс может помешать существованию систем, тем самым дав свободу каждому гражданину. Из-за этого к ней приходят убийцы, которые не справляются со своей задачей. Кстати, девушка не знала о своем предназначении, и потеря памяти окончательно решила её ориентиров. Теперь же протагонистка встречает повстанцев, которые присутствуют в любых историях о тоталитарном режиме как часть общества, способная противостоять порабощению во всех его проявлениях. Лидер повстанцев рассказывает героине все обстоятельства ситуации, и она начинает борьбу с организацией «Комплекс».