Одноклассница была одна, и училась она прилежно, и вроде бы любили её, а потом пропала без вести эта девица. В игре «Root Letter» 15 лет прошло с того момента, как последний раз девочка появлялась за партой, или в обществе. Не смогли её найти полицейские, потому что сложно вычислить местоположение человека, когда у него даже мобильника нет. Безусловно, все ученики класса были очень опечалены внезапным похищением, или же это был несчастный случай. В общем, не получилось обнаружить никаких зацепок, а жертва исчезла без вести, и даже семью свою не завела, вот как жизнь обернулась.
И по прошествии полутора десятка лет герой находит письмо, которое не было отправлено, да только оно от этой девушки, и адресовано ему самому. Протагонист читает на свое имя лист, и узнает страшные тайны и подозрения об одноклассниках, а потому сразу же выстраивается возможная цепь событий. Получается, девушку убили, вот только нельзя так просто определить, кем же является маньяк. У всех есть свои темные тайны, и потому необходимо придерживаться определенного плана действий, чтобы постепенно диалогами заставить расколоться всех своих одноклассников. Они приехали в тот самый класс, и начали оживленно общаться, но инициатива должна оставаться в ваших руках.