Военное правительство средневековой Японии в игре «The Last Blade» пытается обезопасить свой народ от разобщенности и внутренней вражды, но вместо этого лишь разжигает конфликты. Понимая, что аристократические кланы лихо обставили главного генерала, вояки решают активировать своих тайных агентов, среди которых числится и главный герой. Сильный и обладающий большим жизненным опытом этот парень моде изменить ситуацию, если будет убивать ключевых феодалов и их прислужников. Переговоры и попытки мирно уладить все конфликты медленно канули в небытие, не оставив надежд.
Теперь же герой берет в руки катану, и точит её, при этом осознавая, что вскоре придется вторгнуться в чужие владения, чтобы перерезать глотки своим противникам. Эти люди обладают большой властью, уважением и деньгами, а потому из-за приученности народа к послушанию феодалы могут спокойно воздействовать на мнение каждого подданного, живущего в империи. В это же время генерал пытается скоординировать действия своих диверсантов, но его предают в самом дворце, потому что разобщение выгодно для теневых правителей, торговцев оружием и остальной мелкой буржуазии, стремящейся попасть на вершину власти.