Аугменты стали проблемой для человеческой расы после агрессивного вторжения в сектора, принадлежащие Альянсу. В игре «Codex of Victory» с грустью и печалью в душе генералы посылают своих солдат на войну, дабы остановить инопланетного захватчика. Такие ситуации не являются редкостью – всегда найдется народ в галактике, который решит напасть на лысеньких обезьянок с планеты Земля, чтобы отвратительными методами уничтожить колонистов, взяв под контроль базы, ресурсы и технику. Так что отстаивать право на использование небесных тел в различных звездных системах придется вам.
Геймплейной особенностью разработчики объявили возможность создания не просто баз, но и лабораторий, а также других военизированных объектов, которые пригодятся при организации обороны. Геймер имеете в распоряжении большую армию, которой недостаточно для отбития атак, так как в этой эпохе уже во всю мощь применяются специальные орудийные устройства нанесения колоссального урона по площади. То есть, количество солдат и техники теряет смысл без нужной тактики, и всех можно потерять сразу при начале вторжения пришельцев на ваш форпост. Отсюда и необходимость появляется управлять наступлением, контратакой и другими действиями войск.