Джокер явно что-то задумал, раз решил просто сдаться на милость Бетмена. В игре «Batman: Arkham Asylum» антагонист решил сдаться, чтобы спокойно попасть в тюрьму Аркхема. На этом острове содержатся самые опасные преступники, и именно их и хотел освободить враг. Бетмен не подумал об этом и спокойно поместил клоуна в тюрягу, а потом начался бунт, в результате которого на свободу вышли все, кто презираем обществом. Теперь у антагониста есть серьёзный план – накормить всех сывороткой, полученной из генов Бейна, чтобы превратить заключенных в подчиняемых ему монстров.
Бетмен желает предотвратить такое развитие событий, но ему мешают Крок и другие агенты врага, которые стараются поскорее уже убить героя. Кроме того, благодаря заложенным бомбам по всему городу полиция не имеет права передвигаться и предпринимать каких-либо действий, а если кто рискнёт – то на воздух взлетят мирные жители. Таким образом, тюрьма уже дважды бунтует, а Бетмен бегает по городу, пытаясь понять замыслы своего противника. Но клоун оказывается смышленее, потому герой не сразу добирается до него. А вот когда уже Бетмен держит в своих руках глотку противника, тогда всё и заканчивается.