Игра «Super Catboy» не только повествует о протагонисте – антропоморфном коте. Она еще и показывает, что лучшие открытия ученых способны не только улучшить быт всего мира, но и уничтожить всё кровавой рукой творца действующей теории. Главный герой проснулся и понял, что может передвигаться на задних лапках, а также умеет разговаривать и понимать людишек. Он обрадовался этому и поблагодарил своего создателя, который изменил генетический код этого персонажа. Но после нескольких месяцев свободной жизни профессор предложил своему «котенку» начать масштабную операцию по изменению всего мира.
Идея выживания сильнейших и установления антиутопии с диктатурой не сильно понравилась коту, привыкшему к обыденности. В итоге ученый сказал, что «кто не с ним, тот против него». После ссоры со своим протеже началась война между прихвостнями антагониста в виде антропоморфных собак и главным героем. Одев темные очки, протагонист начал своё путешествие в платформере «Super Catboy», и всё ради спасения людей и зверей. Сам персонаж не считает себя ошибкой генетики и природы, но он ожидал от своего хозяина толерантность и мудрость. Победите ученого и остановите его безумный план, и ощутите себя «пушистым» героем!